Einfluss von Formylpeptidrezeptoren auf Coronavirusinfektionen

Formylpeptidrezeptoren (FPRs) sind eine kleine Familie von immunmodulatorischen Molek├╝len, die bei vielen wichtigen menschlichen Erkrankungen wie z.B. bakteriellen und viralen Infektionen, aber auch bei Alzheimer- und Prionenerkrankungen, Immunschw├Ąche, Diabetes sowie Krebs eine Rolle spielen. H├╝llproteinfragmente von Coronaviren sowie einiger anderer Viren modulieren ebenfalls die Aktivit├Ąt dieser Rezeptorgruppe. Interessanterweise sind Fragmente von Coronaviren besonders potente Inhibitoren der FPRs. Die Bedeutung dieses Mechanismus f├╝r den Infektionsverlauf von SARS-CoV-2 Infektionen ist bislang nicht bekannt.

Das Projekt Corona & KI untersucht die Wirkung von SARS-CoV-2 auf Formylpeptidrezeptoren. Auf Basis dieser Ergebnisse sollen KI- basierte Algorithmen entwickelt werden, um die Wirkung von unterschiedlich mutierten Coronaviren auf verschiedene Rezeptorgenvarianten schnell und einfach vorhersagen zu k├Ânnen. Zur Erhebung der notwendigen Messdaten kommen automatisierte Hochdurchsatz-Screening-Methoden zum Einsatz. Die Ergebnisse sollen als Trainingsdaten genutzt werden, um mittels bereits etablierter Feature Selection Modelle und Deep Learning Strategien neue KI- Algorithmen zu entwickeln. Die Vorhersagen des KI-Modells werden dann experimentell ├╝berpr├╝ft und das Modell gegebenenfalls verfeinert. Das optimierte Softwaretool soll dann nachfolgend auch anderen Wissenschaftlern zum Download bereitgestellt werden. Die Projektteilnehmer erwarten, dass ihre KI-Programme neben der Vorhersage der Dosis- Wirkungsbeziehungen von Interaktionspartnern eventuell auch Beitr├Ąge zur Absch├Ątzung von individuellen Risiken und wahrscheinlichen Erkrankungsverl├Ąufen bei Covid-19 leisten k├Ânnen.

Projektmanagement: 
Prof. Dr. Bernd Bufe, Biologe, Arbeitsgruppe Molekulare Immunologie und Immunsensorik, Mitglied im Forschungsschwerpunkt Integrierte Miniaturisierte Systeme (IMS)

Projektpartner: Hochschule Kaiserslautern

Das Projekt wird gef├Ârdert durch das Programm HAW direkt